国家科学技术奖是衡量科技创新和重大成果产出的重要指标之一。聚焦加快建设具有全球影响力的科技创新中心的宏伟目标，上海将科技创新摆在发展的核心位置，依托自身综合优势和开放优势，充分调动科技资源和智力资源，涌现了一大批重大科技成果，闪耀国家科学技术奖励殿堂。
2017年度上海市共有58项牵头及合作完成的重大科技成果荣获国家科学技术奖(2016年为52项)，获奖总数比2016年增加了6项，占全国获奖总数的20.7%，是1999年国家科技奖励制度改革以来，第一次突破20%，也是连续第16年获奖比例超过10%。其中，荣获国家自然科学奖6项(其中，牵头完成3项)，占全国35项国家自然科学奖的17.1%;国家技术发明奖11项(其中，牵头完成5项)，占全国66项国家技术发明奖的16.7%;国家科学技术进步奖39项(其中，牵头完成13项)，占全国170项国家科学技术进步奖的22.9%;中华人民共和国国际科学技术合作奖2人，占全国的28.6%。
在高等级奖项中，2项国家自然科学一等奖，上海参与1项;3项国家科学技术进步特等奖，上海参与2项;21项国家科学技术进步一等奖，上海牵头完成1项，参与完成2项。
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