由于该领域覆盖面广，其研究方向分别为：
资源优化
资源优化管理全面融汇了经济科学和技术及管理科学。本方向的物流工程研究，对基础理论及各类问题的研究已深入到该领域的国际前沿，具有开创性和前沿性。对配送规划、物流共同化、物流管理信息化等方面进行了深入研究。本方向的供应链管理研究，对供应链设计与管理、ERP应用、生产计划与调度、流水机器调度和非流水机器调度、企业运营计算机模拟等方面进行了深入研究，各项研究已深入国际前沿，研究成果广泛应用于企业管理实践。
决策科学
决策科学是应用逻辑推理、定量分析、实证研究等科学方法研究决策科学理论和决策者行为的一门学科。它为个体和群体决策者对众多可择方案的评价、选择、和决策提供科学的方法论。迄今为止，决策科学理论仍有许多值得进一步探讨和完善的前沿领域，同时决策科学的应用，也指导并贯穿于其他相关学科，如，市场学、项目管理、金融财务等学科的研究。
项目管理
项目管理是一门以业务技术为基础，以计算机技术和网络技术为手段，涵盖管理学、经济学、技术科学等多门学科的边缘新兴学科。研究组织内部多种项目的计划、调度、控制和统一管理;将绩效评价应用于项目中，研究针对项目的绩效评价方法和体系;研究项目管理的工作原理和流程，在此基础上研究项目管理信息系统的设计和开发，包括程序设计的研究;研究项目风险的预测、评价方法和理论。
公共工程
公共工程组织管理是以管理学为基础，同时与公共经济学、宏观经济学、工程科学、公共选择理论等学科相互交叉渗透的学科。以公共经济研究所、电子政务研究所等为支撑，高度重视定性研究与定量分析相结合，在公共工程项目决策、项目评价、组织优化以及电子政务等方面较早开展了公共工程组织管理方面的研究，处于国内先进水平，形成了公共工程的组织优化、项目决策、评价以及电子政务等方面的研究特色。
以上4个研究方向也是二级学科，同时，该学科还有以下研究方向：
系统分析与决策、宏观经济管理、技术经济与管理、投资经济分析、金融工程理论与应用、区域发展管理、区域经济与发展战略、交通运输管理、交通运输项目评价、产业组织理论与应用、不确定性分析、中国经济实证分析、管理信息系统与决策支持系统、工业工程。
