复旦大学环境工程在职研究生培养具有环境工程领域坚实的基础理论和宽广的专业知识，掌握解决环境工程领域实际问题的先进技术与方法，具有创新意识，能独立进行环境工程技术研发、工程设计、运行和管理的应用型高层次人才。
培养方式与年限：
1.学制一般为3年，最多不超过5年。其中，课程学习时间一般为1-1.5年，采取进校不离岗的学习方式;学位论文一般在学生所属单位或委托培养单位(以下简称原单位)非脱产完成，时间规定为1.5-2年，不得超过3年;个别因条件限制需要在学校完成论文者，必须提出申请报学校批准，在学校完成论文，时间应控制在1年半以内，不得超过2年。
2.采用课程学习与学位论文并重的培养方式，即同时强调知识和能力的培养，特别注重工程实际能力的培养;凡修满32学分，且提交学位论文，通过学位论文答辩，经复旦大学学位委员会审核批准，则授予工程硕士学位。
3.实行双导师制。对每位工程硕士生在课程学习完成之前，双向选择、确定指导教师，原单位必须选择一位具有高级技术职称的专家作为其兼职指导教师(副导师);两位导师与学生共同商定论文选题，并共同负责指导学生完成其学位论文。
培养方向：
1、污染控制工程
2、清洁生产技术
3、环境生态产业工程
4、环境评价与规划
5、环境健康与安全
课程设置：
环境工程领域工程硕士学生应修课程包括学位课程和非学位课程，共计32学分。其中：学位课程包括自然辩证法、外语、工程数学、环境工程硕士学位基础课及专业课，至少20学分;非学位课程包括专业选修课及环境工程领域前沿讲座，至少12学分。
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